6年間を見据えた教科の時間配分や特別活動など、中高一貫校ならではの特色ある独自のカリキュラムを実践することができます。からまつ学寮での林間学校や自然教室などの人間教育をはじめ、長期休暇中の補充授業、希望者対象の勉強会など、学力とこころをじっくりと育てます。

本校には文化クラブが25、体育クラブが13あります。他の多くの中学校・高校で活動しているメジャーなクラブだけでなく、バトン部、長刀部など、中学校ではユニークなクラブ、女子校ならではのクラブなどもあり、どれも活気に溢れています。
中・高一貫校なので中学校・高校の生徒が一緒になって活動するクラブが多いことも本校の特徴です。中学生は高校生のお姉さんたちについていこうと必死でがんばり、高校の先輩たちも後輩に負けまいと一生懸命です。
それぞれのクラブで目指す目標は違いますが、先輩たちから受け継いだ伝統と守りつつ、より大きな成果をあげることをめざして、毎日活動しています。

本校の生徒会活動はとても活発です。生徒会は、学校での行事、生活、クラブ活動などについて企画、運営していきます。生徒は自主自律の精神を重んじ、自ら率先して行動していきます。それは比治山女子中学高等学校が長い年月をかけて培った伝統です。目立つ大きな行事はもちろんのこと、日々の目立たない活動にも自主的、積極的に取り組んでいく先輩方を見て、後輩達が「私たちもあんな素敵な先輩になって学校を創っていきたい」、このような形で「思い」が継承されていきました。そしてそれが今の活発な比治山女子中学高等学校の気風として受け継がれています。